在密苏里舰上，商震（后）陪同徐永昌接受日本无条件投降
抗战期间，商震任第六战区司令长官、中国驻美国军事代表团团长、军委会办公厅主任、缅甸军事考察团团长等职，曾随蒋介石出席开罗会议，并陪同徐永昌将军在密苏里号上接受日本投降。1947至1949年，商震任同盟国对日管理委员会中国代表兼驻日代表团团长，为审判日本战犯做了大量工作。
反对“霸权主义”
在东京审判之前，商震提出了引渡日本侵略中国的华中派遣军总司令松井石根、第59军司令官谷寿夫、731部队长石井四郎、首任侵华日军总司令西尾寿造、第二任侵华日军总司令畑俊六的要求。同时要求立即逮捕并引渡第三任侵华日军总司令冈村宁次，逮捕并引渡侵华日军第六方面军总司令冈部直三郎、驻华北日军总司令多田骏、第23军司令官酒井隆等。
但麦克阿瑟却提出了由美国单独审判的提议，对此，商震和梅汝璈坚决反对。他们联合苏联、英国、法国等国代表团写了致同盟国战争犯罪调查委员会和远东委员会的报告，其中反对美国独吞抗战胜利果实的霸权主义的提法出自商震之口，受到一致称赞。
商震则谦虚地说，“霸权主义”不是他的创造，“霸权”二字最早出现在希腊历史书中，原指大城邦对一些小城邦的控制。他觉得用它反对强国欺侮、压迫和支配小国、弱国，妄图在世界上称霸很合适，再加上“主义”二字，有把它当做系统理论和主张看待的意思，不知是否合适。
商震的做法得到多国代表团成员的大力支持，美国单独进行审判的做法受到世界各国舆论的强烈谴责。麦克阿瑟为迫使商震改变态度，就向蒋介石告状。当蒋介石向商震问起此事时，商震巧妙地回答蒋介石说：“委座的训示我并没有忘记，只是中国作为四大列强之一，在麦克阿瑟将军提出日本战犯由美国单独审判这样的大是大非问题上，站在其他代表团意见一边，显示异议。”
在各国舆论的压力下，美国只得放弃了单独审判的主张。
引渡山田乙三
当时，有四个国家都提出要引渡战犯山田乙三，而中国驻日军事代表团团长商震提供的山田乙三罪行证据最为确凿。据此，商震根据盟军最高总司令麦克阿瑟关于受害最重的国家优先引渡的原则，说明中国对山田乙三享有无可争辩的引渡理由。
麦克阿瑟则主张在菲律宾的马尼拉设立四国军事法庭，由中国法官担任首席检察官，但商震对此表示拒绝。麦克阿瑟又说，山田乙三由哪一个国家引渡，都是为了伸张正义，维护和平，铲除日本军国主义，如果实在不好分配，就改用最原始的抽签方式。而英国代表团团长巴特斯克则认为，按理应中国引渡山田乙三，再一个办法是把山田乙三改为甲级战犯，由东京法庭审判。对此，麦克阿瑟又提出：东京法庭的甲级战犯已达46人，大大超过了纽堡伦法庭30名甲级战犯的前例。经过一番争论，最后商震等人同意抽签决定。
麦克阿瑟命人做好纸条后，请商震先抽。结果商震一下抽中了山田乙三。这让麦克阿瑟也无可奈何，只得召集除苏联之外的10国驻日军事代表团团长会议，宣布第一批引渡名单（共185人），中国和美国各20人，其他各国分别为15人、12人、8人、7人不等，泰国最少，为两人。
这时，商震得到梅汝璈的消息说：他从检察长基南的汉语翻译郎格兰那里获悉，美国第一批引渡的乙丙级日本战犯，已经从20人增加到45人。
商震急忙与苏联、英国等驻日军事代表团团长商量对策，决定请与美国关系最好的英国代表团团长巴特斯克先去找麦克阿瑟交涉，其他国家的团长也随后赶去找麦克阿瑟要求增加引渡名额。
麦克阿瑟见事已曝光，只得答应中国、英国、法国、澳大利亚、新西兰、菲律宾各增加引渡12名，印度、加拿大各增加5名，荷兰增加两名；并说，对其余的在押战犯，经预审之后，凡是能够确定为乙丙级战犯的，一律引渡到各国受审。
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